健升物流總共設有近5.9萬平方米的倉庫，其中有立體橫樑式貨架倉、平面倉、恒溫倉等等。配備高位叉車以及液壓平臺等先進設施。

  健升物流擁有自主智慧財產權的倉庫管理系統——健升物流綜合資訊管理系統，可根據不同客戶的需求量身設定功能模組，並且配備了條碼和射頻識別（RFID）技術模組，方便實現與客戶系統對接。除滿足日常收發貨、IRA盤點、報表、結費等功能外，還根據實際需求增加了對貨物狀態及產品庫齡的控制，以確保貨物合格出倉。